IgE値が高い場合には、アレルギー疾患が関与していることがありますが、他にも以下が影響していることがあります。

IgE値高値を示すことのある疾患、状態の例
・アレルギー疾患（気管支喘息、アトピー性皮膚炎、アレルギー性鼻炎、食物アレルギーなど）
IgE値はアレルギー症状の強さを示すとは限らないものではあります
・寄生虫疾患
・一部の膠原病
・肝疾患（急性肝炎、慢性肝炎、肝硬変、原発性肝癌など）
・気管支肺アスペルギルス症
・IgE骨髄腫
・高IgE症候群
・ネフローゼ症候群
・ホジキン病
・ベーチェット病
・Wiskott-Aldrich症候群（ウィスコット・アルドリッチ症候群）
・DiGeorge症候群（ディジョージ症候群）

一方で、IgE値が低値となることがある疾患例として、多発性骨髄腫(IgE型以外)　、低ガンマグロブリン血症、慢性リンパ性白血病、サルコイドーシス、重症複合免疫不全症などが挙げられています。