チアシードはオメガ3脂肪酸を多く含み、チアシードの吸水性から膨満感を得ることでダイエットに取り入れている方もいらっしゃるかと思います。
オメガ3脂肪酸以外に、カルシウム、リン、マグネシウム、マンガン、銅、亜鉛、鉄及びナイアシンを多く含み、糖吸収をおだやかにする面がありますが、多くの食材同様、リスク面がないわけではありません。

リスク可能性について

・サルモネラ感染の可能性

チアシードの管理状態等に依りますが、いままでにサルモネラ感染した発芽チアシード（パウダー）を摂取して感染した事例もあり、2014年にアメリカ、カナダ等でリコールがなされています。
生のチアシードも日本国内に輸入されていますが、生食をすることが多いチアシードですので、特に生のチアシードは安全を期すうえでの対策としては、火を通すのが望ましいでしょう。

https://www.fsc.go.jp/fsciis/foodSafetyMaterial/show/syu04050280104
https://www.fda.gov/Food/RecallsOutbreaksEmergencies/Outbreaks/ucm399235.htm

ちなみに、生のフラックスシードにはシアン化合物（青酸配糖体）が含まれるため、輸入規制が成されています。

・カビ毒アフラトキシンによる食中毒の可能性

ご存知の方も多くいらっしゃると思いますが、ナッツ類、豆類、穀類、バジルシードもそうですが、チアシードからもカビ毒のアフラトキシンが検出されることがあり、摂取をすると下痢、嘔吐など食中毒症状を引き起こします。
含有物を見た目や臭いや味で見極めるのは難しいですが、過去に回収となった産地の商品、以前から取り扱っているわけではないあまり聞き慣れないメーカーや輸入者の商品、パウダーなど加工商品については留意しておくのが良いかと思います。

https://www.mhlw.go.jp/stf/houdou/0000074865.html

・アレルギーの可能性

チアシードはシソ科サルビア属の植物の種子ですが、同じくシソ科植物であるオレガノ、タイムにアレルギー反応がある方は、チアシードにアレルギー症状が出る可能性が示唆されています。
またチアシードは、ごま、マスタードシード、マスタードとの交差反応があるとの意見もあります。
チアシードのアレルギーについてはこれからさらに明らかになる部分もあるかと思いますが、これらの意見についても意識しておきたいところです。

・軟便

経験している方も少なくないかと思いますが、チアシードを摂取して軟便になったり、ガスが多く出るということがあります。下痢状態が続くと栄養状態に悪影響となりますので、無理に継続摂取しないのが望ましいでしょう。

・嚥下時の食道の閉塞

チアシードが十分に水を吸収していない状態で摂取したり、一緒に摂取する水分が十分でない場合に、チアシードをのみ込む際に食道が閉塞する可能性もあります。
喘息の方は特に意識しておきたい点です。

・α-リノレン酸の摂取過多によるリスク可能性

チアシードにはα-リノレン酸が多く含まれます。α-リノレン酸の摂取過多になると、前立腺がんになるリスクが高くなるとの意見もありますが、チアシードなど植物由来のα-リノレン酸においてのリスクについては否定的な意見もあります。
摂取時には適量摂取を心がけるのが良いでしょう。

また、否定的な意見もありますが、血液が薄くなる可能性、血糖値を過剰にコントロールする可能性、血圧低下を挙げる声もあります。またどの作物にも言えることですが、農業用殺虫剤や除草剤による影響もあります。気になる方は有機商品を選択しましょう。ただし有機商品であっても、上記リスクについては同様に起こり得ます。

妊娠中、授乳中の使用について

チアシードには妊娠中や授乳中にも必要な栄養素が含まれ、便秘改善に貢献し得、妊娠中、授乳中も摂取が望ましいとする意見もありますが、妊娠中、授乳中のチアシードの摂取については、子供への影響を含め安全性が確認されているわけではありません。
チアシードを摂取して軟便になる方は特に、他に摂取した食物の栄養吸収を阻害する場合もありますので、安全性が確認されるまでは摂取は控えるのが望ましいかと思います。

尚、オメガ3脂肪酸を多く含むフラックスシードについては、妊娠中に摂取することで、エストロゲンに作用し、早産リスクがあるとの意見があります。

参考：
https://www.healwithfood.org/side-effects/chia-seed-allergies.php
https://www.seedguides.info/chia-seeds/
https://www.webmd.com/vitamins-supplements/ingredientmono-1224-chia.aspx?activeingredientid=1224&activeingredientname=chia
https://chiaseeds.net/chia-seed-side-effects/